类器官模型能否预测双抗疗效？患者来源淋巴瘤3D球状体联合空间单细胞蛋白组解析耐药机制-尧图网络科技

类器官模型能否预测双抗疗效？患者来源淋巴瘤3D球状体联合空间单细胞蛋白组解析耐药机制

双特异性抗体通过同时识别肿瘤抗原和T细胞表面分子，将效应T细胞募集至肿瘤细胞附近并触发细胞毒性杀伤，但其在实体瘤中的疗效仍受到多重耐药机制限制。实体瘤内部普遍存在靶抗原表达异质性、抗原下调或缺失，使部分肿瘤细胞能够逃逸识别；致密的细胞外基质、异常血管及较高的组织间质压力，也会限制抗体药物和T细胞向肿瘤核心区域渗透。同时，肿瘤微环境中的Treg、肿瘤相关巨噬细胞、髓源抑制性细胞及免疫抑制性细胞因子，可削弱T细胞活化并促进耗竭，表现为PD-1、TIGIT、LAG-3等抑制性受体升高。此外，实体瘤中肿瘤细胞与免疫细胞的空间分隔、代谢竞争和缺氧状态，也可能使双特异性抗体即使完成细胞桥接，仍难以形成持续有效的免疫突触和杀伤反应。因此，解析耐药相关细胞状态及其空间组织方式，是优化双特异性抗体患者分层和联合治疗策略的重要前提。

近期，《Blood》发表了一篇“Patient-Derived Lymphoma Spheroids Reveal Predictive Markers of Glofitamab Resistance in Relapsed/Refractory B-NHL”，该研究利用患者来源3D淋巴瘤球状体探讨了双特异性抗体（bsAbs）Glofitamab 在治疗 B 细胞非霍奇金淋巴瘤（B-NHL）时的耐药机制。下面主要从课题设计和技术路线进行展开分享。

一、课题设计 (Research Design)

该研究的核心思路是利用患者来源的淋巴瘤球状体（PDLS）这一 3D 体外模型，模拟肿瘤微环境（TME），并结合多组学技术深入挖掘影响药物疗效的细胞和分子因素。

1.研究背景与痛点：虽然 Glofitamab（CD20 × CD3 双抗）在复发/难治性（R/R）B-NHL 中表现出良好疗效，但仍有部分患者产生耐药，其背后的耐药机制尚未完全明确。

2.核心科学问题：哪些免疫微环境特征决定了患者对 Glofitamab 的敏感性或耐药性？能否通过干预这些特征来增强疗效？

3.主要研究目标：

建立 R/R B-NHL 患者的 PDLS 模型并进行体外药敏测试。
通过对比“高反应者”和“低反应者”，鉴定预测耐药的生物标志物。
在体外模型中验证干预手段（如联合用药或细胞清除）克服耐药的效果。

4.样本量与模型：研究收集了 39 份 R/R B-NHL 患者样本（包括滤泡性淋巴瘤 FL、转化型 FL 和弥漫大 B 细胞淋巴瘤 DLBCL），从中建立 3D PDLS 模型。

二、技术路线 (Technical Route)

文章采取了从“功能表型”到“深度组学”再到“功能验证”的系统性研究路径：

1. 模型建立与药效评估

PDLS 建立：将患者的淋巴结活检组织或外周血单核细胞（PBMC）进行机械解离，在含有细胞因子的培养基中利用超低贴壁（ULA）板培养，形成 3D 球状体（Day 0-3）。
体外给药处理：在 Day 3 加入 Glofitamab（0.1 nM 等不同浓度），处理 72 小时。
疗效分析：在 Day 6 收集细胞，通过多参数流式细胞术检测 B 细胞耗竭率，根据耗竭程度（以 50% 为界）将患者分为“高反应组”和“低反应组”。

2. 多维度免疫分型 (Multi-omics Profiling)

为了寻找耐药标志物，研究者在 Day 0 对原始样本进行了深度解析：

单细胞转录组测序 (scRNA-seq, 10X Genomics Flex/5')：对 12 例样本进行单细胞测序，分析 T 细胞的活化/耗竭评分、TCR 克隆性以及细胞间的通讯（使用 CellChat 软件）。
空间蛋白质组学 (PCF/CODEX)：使用 53 种标志物的高倍多色荧光成像，分析组织切片中恶性 B 细胞与免疫细胞（如 Tfh 细胞）的空间邻近性及组织架构。
表型分析：利用流式细胞术检测 T 细胞上免疫检查点（如 TIGIT, LAG3, PD1）的表达水平。

3. 关键发现与机制挖掘

CD8+ T 细胞状态：高反应者拥有高杀伤活性的 CD8+ T 细胞；而低反应者表现出明显的 CD8+ T 细胞耗竭，且高表达 TIGIT。
Tfh 细胞的保护作用：低反应组中**滤泡辅助性 T 细胞（Tfh）**显著富集。空间分析显示 Tfh 与恶性 B 细胞距离更近，通过 IL21 和 CXCL13 信号通路促进肿瘤细胞存活。

4. 功能验证与临床验证