随着高通量测序以及生物信息学的发展,各物种基因组序列快速释放,为基因家族分析和论文写作带来了契机。基因家族的生物信息学分析也为后续基因功能研究提供了强有力的理论支撑,在数据挖掘中发挥着越来越重要的作用。更重要的是,快速、高效、高质量发表相关论文可以辅助科研工作者在晋升道路上提速。
专题一、文献研读和方法解读
1.基因家族分析文献解读;
2.基因组学分析技巧;
生物信息大数据分析思路;
专题二、软件安装和实操
1.Linux系统介绍;
2.常用命令介绍(vi,cd等);
3.相关软件安装;
实操练习;
专题三、基因家族注释文件解读
1.候选基因下载方式;
2.文件解读(基因组,GFF注释信息,蛋白信息,cds等);
3.Pfam保守结构域分析;
鉴定基因家族所有基因;
专题四、基因家族生信分析
1.基因家族理论与分析技巧;
2.进化树(mega构建进化树,进化树的美化);
3.基因结构分析(外显子内含子,motif分析);
基因家族染色体定位;
专题五、基因家族高级分析
1.基因组复制事件(全基因组、串联重复等)分析;
2.tbtools绘图基因复制事件;
KaKs分析;
专题六、基因家族表达分析
1.基因家族种间的共线性分析;
2.转录组数据分析基因家族的表达量和功能;
3.转录调控分析(miRNA和启动子顺势作用元件);
4.案例实操;
个性化分析方法总结;
专题七、高水平SCI论文分析撰写思路与绘图技巧
1.基因家族高级分析;
2.如何深度分析基因家族使IF跨越5分门槛。
3.SCI论文整理技巧;
SCI论文绘图技巧;
专题八、复习与答疑讨论
1.课程复习与总结(知识点梳理)
2.实例回顾、训练、巩固。
3.答疑与讨论(大家提前把问题整理好)
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